* An acient bottleneck in the Lost Pines of central Texas [#h374159f] - 日時:3月x2日 13:00- - 場所:N23 - 発表者:富田基史 ** 文献 [#o570fc70] *** レポートした文献 [#a25c0050] + Al-Rabab’ah, M. A. and C. G. Williams. 2004. An acient bottleneck in the Lost Pines of central Texas. Molecular Ecology 13:1075–1084. *** その他参考にした文献 [#da8c7024] + Cornuet, J. M. and G. Luikart. 1996. Description and power analysis of two tests for detecting recent population bottlenecks from allele frequency data. Genetics 144:2001–2014. + Dyer, R. J. and V. L. Sork. 2001. Pollen pool heterogeneity in shortleaf pine, Pinus echinata Mill. Molecular Ecology 10:859–866. + Garza, J. C. and E. G. Williamson. 2001. Detection of reduction in population size using data from microsatellite loci. Molecular Ecology 10:305–318. + Ledig, F. T., M. T. Conkle, B. Bermejo-Velazquez, T. Eguiluz-Piedra, P. D. Hodgskiss, D. R. Johnson, and W. S. Dvorak. 1999. Evidence for an extreme bottleneck in a rare mexican pinyon: Genetic diversity, disequilibrium, and the mating system in Pinus maximartinezii . Evolution 53:91–99. + Luikart, G., F. W. Allendorf, and J.-M. Cornuet. 1998. Distortion of allele frequency distributions provies a test for recent population bottlenecks. Journal of Heredity 89:238–247. + Nei, M. 1987. Molecular Evolutionary Genetics. Columbia University Press, New York, USA. ** 要旨 [#l7eabaca] 過去の気候変動にともなって分布域を縮小してきた種は,強度のbottleneck を経て,最終的には個体 群レベルで絶滅していくであろうと予想されている.しかしながら,Pinaceae のように広範囲に分布す る種では,有効個体群サイズNe が大きいため,bottleneck を直接検出することは困難である.そこで Al-Rabab’ah and Williams (2004) は,近年提唱されたいくつかの推定法により,北アメリカに広範囲に 分布するP. taeda でbottleneck を検出することを試みた. 分布の西端にあたるLost Pines の群落では,過去のbottleneck を検出できたが,より広範囲に分布し ているEast Texas の群落では,用いたすべての検定でbottleneck は検出できなかった.対立遺伝子頻度 の分布は,Lost Pines の群落でより歪んでいたことから,集団の縮小の段階で,機会的に少数対立遺伝子 が失われていった可能性が示唆されたが,対立遺伝子数などのパラメータは,ほとんど変わらなかった. このreview では,おもに長期的な時間スケールでの集団の縮小による,集団の遺伝的多様性の低下を, 数理モデルから推定した例を紹介するとともに,その推定方法も簡単に解説する予定である.また,同時に 集団の多様性を基本的な方法についても解説する. ** 資料 [#w82ce70c] - レジュメ(PDF) &ref(050221-Alrababah-MolEcol-revised.pdf); ** コメント [#l467ef0f] -つまらなかったです -- [[とみた]] &new{2005-04-09 19:04:09 (土)}; #comment