* An acient bottleneck in the Lost Pines of central Texas [#h374159f]

- 日時:3月x2日 13:00-
- 場所:N23
- 発表者:富田基史

** 文献 [#o570fc70]
*** レポートした文献 [#a25c0050]
+ Al-Rabab’ah, M. A. and C. G. Williams. 2004. An acient bottleneck in the Lost Pines of central Texas. Molecular Ecology 13:1075–1084.

*** その他参考にした文献 [#da8c7024]
+ Cornuet, J. M. and G. Luikart. 1996. Description and power analysis of two tests for detecting recent population bottlenecks from allele frequency data. Genetics 144:2001–2014.
+ Dyer, R. J. and V. L. Sork. 2001. Pollen pool heterogeneity in shortleaf pine, Pinus echinata Mill. Molecular Ecology 10:859–866.
+ Garza, J. C. and E. G. Williamson. 2001. Detection of reduction in population size using data from microsatellite loci. Molecular Ecology 10:305–318.
+ Ledig, F. T., M. T. Conkle, B. Bermejo-Velazquez, T. Eguiluz-Piedra, P. D. Hodgskiss, D. R. Johnson, and W. S. Dvorak. 1999. Evidence for an extreme bottleneck in a rare mexican pinyon: Genetic diversity, disequilibrium, and the mating system in Pinus maximartinezii . Evolution 53:91–99.
+ Luikart, G., F. W. Allendorf, and J.-M. Cornuet. 1998. Distortion of allele frequency distributions provies a test for recent population bottlenecks. Journal of Heredity 89:238–247.
+ Nei, M. 1987. Molecular Evolutionary Genetics. Columbia University Press, New York, USA.

** 要旨 [#l7eabaca]
過去の気候変動にともなって分布域を縮小してきた種は,強度のbottleneck を経て,最終的には個体
群レベルで絶滅していくであろうと予想されている.しかしながら,Pinaceae のように広範囲に分布す
る種では,有効個体群サイズNe が大きいため,bottleneck を直接検出することは困難である.そこで
Al-Rabab’ah and Williams (2004) は,近年提唱されたいくつかの推定法により,北アメリカに広範囲に
分布するP. taeda でbottleneck を検出することを試みた.
分布の西端にあたるLost Pines の群落では,過去のbottleneck を検出できたが,より広範囲に分布し
ているEast Texas の群落では,用いたすべての検定でbottleneck は検出できなかった.対立遺伝子頻度
の分布は,Lost Pines の群落でより歪んでいたことから,集団の縮小の段階で,機会的に少数対立遺伝子
が失われていった可能性が示唆されたが,対立遺伝子数などのパラメータは,ほとんど変わらなかった.

このreview では,おもに長期的な時間スケールでの集団の縮小による,集団の遺伝的多様性の低下を,
数理モデルから推定した例を紹介するとともに,その推定方法も簡単に解説する予定である.また,同時に
集団の多様性を基本的な方法についても解説する.

** 資料 [#w82ce70c]
- レジュメ(PDF) &ref(050221-Alrababah-MolEcol-revised.pdf);

** コメント [#l467ef0f]
-つまらなかったです -- [[とみた]] &new{2005-04-09 19:04:09 (土)};

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