分野ゼミ/文献紹介ゼミ/2005-03-x2 vol.x2 のバックアップの現在との差分(No.1) - 北海道大学大学院　農学院・農学研究院農学部造林学研究室

バックアップ一覧
ソースを表示
バックアップを表示
分野ゼミ/文献紹介ゼミ/2005-03-x2 vol.x2 は削除されています。
- 1 (2005-04-10 22:40:12 (日))

追加された行はこの色です。
削除された行はこの色です。

 * An acient bottleneck in the Lost Pines of central Texas [#h374159f]
 
 - 日時：3月x2日 13:00-
 - 場所：N23
 - 発表者：富田基史
 
 ** 文献 [#o570fc70]
 *** レポートした文献 [#a25c0050]
 + Al-Rabab’ah, M. A. and C. G. Williams. 2004. An acient bottleneck in the Lost Pines of central Texas. Molecular Ecology 13:1075&#8211;1084.
 
 *** その他参考にした文献 [#da8c7024]
 + Cornuet, J. M. and G. Luikart. 1996. Description and power analysis of two tests for detecting recent population bottlenecks from allele frequency data. Genetics 144:2001&#8211;2014.
 + Dyer, R. J. and V. L. Sork. 2001. Pollen pool heterogeneity in shortleaf pine, Pinus echinata Mill. Molecular Ecology 10:859&#8211;866.
 + Garza, J. C. and E. G. Williamson. 2001. Detection of reduction in population size using data from microsatellite loci. Molecular Ecology 10:305&#8211;318.
 + Ledig, F. T., M. T. Conkle, B. Bermejo-Velazquez, T. Eguiluz-Piedra, P. D. Hodgskiss, D. R. Johnson, and W. S. Dvorak. 1999. Evidence for an extreme bottleneck in a rare mexican pinyon: Genetic diversity, disequilibrium, and the mating system in Pinus maximartinezii . Evolution 53:91&#8211;99.
 + Luikart, G., F. W. Allendorf, and J.-M. Cornuet. 1998. Distortion of allele frequency distributions provies a test for recent population bottlenecks. Journal of Heredity 89:238&#8211;247.
 + Nei, M. 1987. Molecular Evolutionary Genetics. Columbia University Press, New York, USA.
 
 ** 要旨 [#l7eabaca]
 過去の気候変動にともなって分布域を縮小してきた種は，強度のbottleneck を経て，最終的には個体
 群レベルで絶滅していくであろうと予想されている．しかしながら，Pinaceae のように広範囲に分布す
 る種では，有効個体群サイズNe が大きいため，bottleneck を直接検出することは困難である．そこで
 Al-Rabab’ah and Williams (2004) は，近年提唱されたいくつかの推定法により，北アメリカに広範囲に
 分布するP. taeda でbottleneck を検出することを試みた．
 分布の西端にあたるLost Pines の群落では，過去のbottleneck を検出できたが，より広範囲に分布し
 ているEast Texas の群落では，用いたすべての検定でbottleneck は検出できなかった．対立遺伝子頻度
 の分布は，Lost Pines の群落でより歪んでいたことから，集団の縮小の段階で，機会的に少数対立遺伝子
 が失われていった可能性が示唆されたが，対立遺伝子数などのパラメータは，ほとんど変わらなかった．
 
 このreview では，おもに長期的な時間スケールでの集団の縮小による，集団の遺伝的多様性の低下を，
 数理モデルから推定した例を紹介するとともに，その推定方法も簡単に解説する予定である．また，同時に
 集団の多様性を基本的な方法についても解説する．
 
 ** 資料 [#w82ce70c]
 - レジュメ(PDF) &ref(050221-Alrababah-MolEcol-revised.pdf);
 
 ** コメント [#l467ef0f]
 -つまらなかったです -- [[とみた]] &new{2005-04-09 19:04:09 (土)};
 
 #comment