An acient bottleneck in the Lost Pines of central Texas †

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文献 †

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レポートした文献 †

  1. Al-Rabab’ah, M. A. and C. G. Williams. 2004. An acient bottleneck in the Lost Pines of central Texas. Molecular Ecology 13:1075–1084.
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その他参考にした文献 †

  1. Cornuet, J. M. and G. Luikart. 1996. Description and power analysis of two tests for detecting recent population bottlenecks from allele frequency data. Genetics 144:2001–2014.
  2. Dyer, R. J. and V. L. Sork. 2001. Pollen pool heterogeneity in shortleaf pine, Pinus echinata Mill. Molecular Ecology 10:859–866.
  3. Garza, J. C. and E. G. Williamson. 2001. Detection of reduction in population size using data from microsatellite loci. Molecular Ecology 10:305–318.
  4. Ledig, F. T., M. T. Conkle, B. Bermejo-Velazquez, T. Eguiluz-Piedra, P. D. Hodgskiss, D. R. Johnson, and W. S. Dvorak. 1999. Evidence for an extreme bottleneck in a rare mexican pinyon: Genetic diversity, disequilibrium, and the mating system in Pinus maximartinezii . Evolution 53:91–99.
  5. Luikart, G., F. W. Allendorf, and J.-M. Cornuet. 1998. Distortion of allele frequency distributions provies a test for recent population bottlenecks. Journal of Heredity 89:238–247.
  6. Nei, M. 1987. Molecular Evolutionary Genetics. Columbia University Press, New York, USA.
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要旨 †

過去の気候変動にともなって分布域を縮小してきた種は，強度のbottleneck を経て，最終的には個体 群レベルで絶滅していくであろうと予想されている．しかしながら，Pinaceae のように広範囲に分布す る種では，有効個体群サイズNe が大きいため，bottleneck を直接検出することは困難である．そこで Al-Rabab’ah and Williams (2004) は，近年提唱されたいくつかの推定法により，北アメリカに広範囲に 分布するP. taeda でbottleneck を検出することを試みた． 分布の西端にあたるLost Pines の群落では，過去のbottleneck を検出できたが，より広範囲に分布し ているEast Texas の群落では，用いたすべての検定でbottleneck は検出できなかった．対立遺伝子頻度 の分布は，Lost Pines の群落でより歪んでいたことから，集団の縮小の段階で，機会的に少数対立遺伝子 が失われていった可能性が示唆されたが，対立遺伝子数などのパラメータは，ほとんど変わらなかった．

このreview では，おもに長期的な時間スケールでの集団の縮小による，集団の遺伝的多様性の低下を， 数理モデルから推定した例を紹介するとともに，その推定方法も簡単に解説する予定である．また，同時に 集団の多様性を基本的な方法についても解説する．

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資料 †

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コメント †


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分野ゼミ/文献紹介ゼミ/2005-03-x2 vol.x2 のバックアップ(No.1)