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変動環境下（CO2増加による温暖化と窒素沈着量の増加する環境）での森林管理を行う基礎データを収集している。その目的は、もちろん尽瘁の生存基盤としての森林の保全である。そして、最も強く願っていることは生産業としての木材生産を持続的に行う科学的根拠を得る事にある。詳しくは以下の「木材生産と生理生態研究の意義」にて主張している。
各種環境と樹木とその集団の成長との関係を解明し、森林育成と森林生態系修復の基礎学となる体系を森林生理生態学と呼ぶ。動物学を基礎に発展してきた体系では、体内の応答を重視した環境生理学（植物では生態生理学）という概念があり、固着性を特徴とする植物では、より環境を重視して生理生態学の体系が進展してきた。
私たちの森林生理生態学へのアプローチは、樹木の光合成活動を縦軸に森林動態解析を横軸として樹木の成長から森林の発達へ迫るように心がけている。それは光合成産物がどのように分配されるか、という見方と考え方である。タワー観測を通じて初めて認識できた森林環境形成作用（「森林は環境を自ら造る」）と植物の環境応答のデータを連動させる概念図（schema）を得た。下左図は、1990年以降蓄積してきた森内微気象と樹木の個葉レベルの生理解剖学的データの連携である(Koike et al. 2001)。
左図：森林樹木の生活史の各段階における環境要因。この図は職を得て以来、影響を受け続けている中静（淺野）透氏の総説(Nakashizuka 2001)を基礎に小池・中静(2004)として公開した。中静氏の学問を良く知るためには「森のスケッチ」の一読をお勧めする。
右図：初めてデータにした林内微気象のデータ。光の垂直変化は葉量の垂直変化と同じであった。これは実感できる。一方、CO2濃度の変化は見えないが、あまりに動的であった。赤の矢印が示すように、林床近くはとっくに2040年以降のCO2環境であるが、樹冠では（晴天日ではなく）薄曇り日には320ppm以下に低下していた。周囲の大気より約70ppmも低いCO2濃度であり、野外での光合成機能の活動の結果を実感した(Koike et al. 2001、小池ら 2004)。
人為攪乱（＝森林域の改変；degradation)や台風など自然攪乱の結果、森林面積が減少し期待した森林へと誘導できずに「荒廃地」となった土地が多く存在する。さらに特殊土壌（強酸性土壌・蛇紋岩土壌・塩類化など）地帯での緑化が切実な課題として迫っている。森林生理生態学の使命の一つには、この荒廃地の再生を目標として生態系修復を成功する体系の構築がある。 ここで、2002年までの理念と成果の一部は、良き仲間、北尾光俊氏・香山雅純氏とともに根の研究会の雑誌「根の研究」に「変動環境下における冷温帯樹木の根系の発達と成長」としてまとめた。この研究をまとめた背景にはIGBP(1998)が指摘した「ARD方式」がある。
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進行し続ける変動環境（酸性雨。大気中CO2濃度による温暖化を中心とした）のもとで、木質資源生産だけを見ても針葉樹で30〜40年、銘木とされる広葉樹では100〜200年の生産期間が必要とされる。この変動環境を意識した造林学が求められる。1989年に米国、Duke大学のPhytotronその進行速度は急加速しています。このような変動環境に対し、森林植物がどのように応答するのかを明らかにすることは、自然環境を保全する上でも、人類の生活環境を健全に保つためにも必要不可欠です。
私たちは、野外実験と制御環境を利用して、大気CO2濃度の上昇や窒素沈着、特殊土壌に対する森林植物の応答を、北大北方生物圏フィールド科学センターや森林総合研究所などとも協力しながら研究しています。また、近年では世界レベルで問題となっている山火事跡地の再生メカニズムの生理生態学や侵入種の制御に関する研究をニセアカシアをモデルとして生態学生理的手法を用いて研究を始めています。
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新・生物多様性国家戦略(2002年）は1995年版を基礎に採択された。この「戦略」には「３つの危機、４つの理念、７つの取り組み」(*)が掲げられ、それらの具現化には「自然再生推進法」を初めとする法律が整備されつつある。これらの中に、生物多様性の保全が謳われており、まさに林学が導入されて以来、追求してきた森林管理（→領主が狩猟・収穫を得る山造り）の理念が21世紀に国民の手に届く時代が到来した。 工事中
